Untuk merealisasikan visi, misi, dan tujuan yang telah ditetapkan dibutuhkan sistem pengorganisasian kerja yang kokoh. Distribusi tugas dan tanggung jawab dilaksanakan dengan pendekatan kolektifitas dan sinergisitas agar terjadi kebersamaan dan keterpaduan dalam melaksanakan tugas dan tanggung jawab tersebut. Adapun pembagian tugas dan tanggung jawab STAI Nahdlatul Ulama (STAINU) Malang dapat dijabarkan sebagai berikut:

Untuk merealisasikan visi, misi, dan tujuan yang telah ditetapkan dibutuhkan sistem pengorganisasian kerja yang kokoh.